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ds案例 | wilforine可增强mdr癌细胞对化疗药物的敏感性
计算模拟平台
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ds案例 | wilforine可增强mdr癌细胞对化疗药物的敏感性
biovia discovery studio 案例
j9九游会老哥俱乐部交流的解决方案 | 2020-11-24 13:18
摘要
来源:计算机模拟平台

多重耐药(mdr)是目前癌症治疗的主要障碍,p-糖蛋白(p-gp)的过度表达是导致化疗耐药性的最常见原因之一。从天然产物中开发新的p-gp抑制剂是对抗mdr癌症的一种有前景的策略。在天然倍半萜化合物中,倍半萜吡啶类生物碱表现出多种生物特性。因此,在本研究中,我们评估了wilforine对p-gp表达和功能的调节作用。进一步研究了wilforine介导的p-gp抑制的分子机制和动力学模型。


子对接(molecular docking)是基于结构药物设计的核心模拟手段,依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程,模拟受体-配体相互作用,预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术,科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选,药物分子的结构改造,配体和受体相互作用的机理研究等工作,从而大大提高实验效率。在  这一分子模拟的综合平台中,分子对接程序包含libdock、cdocker、flexible docking,这三种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为其提供配体受体间相互识别的“利器”。

wilforine可增强mdr癌细胞对化疗药物的敏感性

ref:phytomedicine. accepted 30 april 2020, if=4.268

链接: 


一、研究背景

多重耐药(mdr)是目前癌症治疗的主要障碍广泛研究了mdr的多种细胞机制,例如调节细胞凋亡的转录信号通路,恢复dna修复能力,改变肿瘤微环境诱导获得性耐药各种疗法,以及并减少药物的细胞内积累增加磷酸腺苷的流出活动盒(abc)转运蛋白。在人类abc转运蛋白超家族中,p-糖蛋白(p-gp, abcb1)、多耐药相关蛋白1 (mrp1, abcc1)和乳腺癌耐药蛋白(bcrp, abcg2)是最常见的耐药原因p-gp的分子活性必须由atp水解的能量引发。p-gp广泛分布于全身,可保护细胞免受异种生物和有毒物质的侵害。然而,已在多种类型的mdr癌症中发现p-gp的过度表达,许多抗癌药物(例如紫杉烷、长春花生物碱和蒽环类药物)p-gp的底物。因此,联合使用低毒性p-gp抑制剂是治疗mdr癌症的一个有前景的方法。


雷公藤是一种木本藤本植物,它含有许多具有重要生物活性的天然成分,其中倍半萜吡啶类生物碱如wilforine、wilfordine、wilforgine是主要的生物活性成分,但是并没有对他们的机制做过多的阐明。另外,尚未研究人癌细胞中的mdr逆转能力。在本研究中,我们评估了wilforine对p-gp表达和功能的调节作用。进一步研究了由wilforine介导的p-gp抑制的分子机制和动力学模型。此外,在mdr癌细胞系中评估了wilforine的mdr逆转能力,证明了将wilforine与现有的化学治疗药物联合使用可被认为是抗mdr癌症的潜在治疗方法。


研究过程

在这项研究中,作者做了一系列生物实验验证了wilforinep-gp底物,竞争性结合导致了p-gp构象的变化。wilforine对p-gp外排功能表现出显著的抑制作用,并且以剂量依赖的方式刺激p-gp atp酶活性,但在实验的过程中发现wilforine并不影响verapamil对p-gp atp酶的活性。由于p-gp的结构包含两个疏水性跨膜结构域(tmd)和两个亲水性核苷酸结合结构域(nbd),作者猜测wilforine和verapamil与p-gp的结合位点不同。为了验证这一假设,作者采用biovia discovery studio程序中的cdocker进行了分子对接。结果显示wilforine可p-gp中的lys177、lys185、glu180和lys883形成相互作用,而维拉帕米与p-gp中arg258、ser1073、gln1077、val1076和ile1111形成相互作用。并且wilforine和verapamil与p-gp结合能力很强,结合能分别为98.66 kcal/mol和54.89 kcal/mol。总之wilforine可能通过与tmd结合而影响p-gp的外排功能。


三 结论

在这项研究中,研究表明wilforine通过竞争性抑制p-gp外排功能,并以剂量依赖性方式刺激基础p-gp atp酶活性。由于它使mdr癌细胞对化疗药物重新敏感,因此在mdr癌症中,wilforine可能是化学疗法的潜在辅助疗法。

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1 wilforineverapamilp-glycoprotein的相互作用图


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