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讲座主题： 2021版本新功能介绍
讲座时间：2021年3月5日（周五），14:00
直播地址： ，或扫描下方二维码
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本次讲座主要针对向大家解读与展示 2021版本新功能简介。
分子动力学模拟
• 新增msld bias optimization and production:简化了用于计算组合库分子相对结合自由能工作流程，更好地进行先导化合物的筛选优化；模拟竞争性结合，经过验证，计算效率是传统fep的20倍。
图1：通过msld方法计算组合库中分子的相对结合自由能
• 新增支持gpu(linux)的基于charmm-domdec的自由能微扰方法程序charmm relative fep calculations计算相对结合自由能。
• 对一些程序增加了支持gpu计算的功能，提高了计算速度和效率，如：
dock proteins (zdock)：比cpu快十几倍。
dynamics (namd) 和 solvate with explicit membrane:比8 cpus快7倍。
抗体理性设计
• 改善了计算抗体黏度、聚集等计算结果呈现方式，增加电荷表面和聚集打分表面的显示；
图2：增加电荷表面和聚集打分表面图
• 优化predict humanizing mutations protocol（抗体人源化计算）参数，使得导入germline文件更加容易。
药效团
• 改善了药效团数据库和基于配体的药效团方法，加入了基于非键相互作用的药效特征。
图3：基于非间相互作用药效特征
第三方程序的更新
• charmm版本更新至c44b2
• modeler版本更新至v9.24
• dmol3版本更新至v2021
• 抗体模板库更新至2020年7月
与最新发布的biovia pipeline pilot 2021相兼容
注: 本次网络培训属于2021年生命科学模拟技术系列讲座，我们会陆续推出后续的讲座，最新讲座安排请关注j9九游会老哥俱乐部交流的网站或联系j9九游会官网索取相关资料。