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q&a | 2020年10月biovia discovery studio q&a精选
十月精选
j9九游会老哥俱乐部交流的解决方案 | 2020-09-29 16:44
每月初，创腾科技生命科学模拟技术部都会通过微信公众号定期总结 biovia 用户在软件使用过程中产生的一些具有代表性的问题。基于我们的工程师团队在分子模拟领域内十多年的经验，定期为大家带来实实在在的技术干货分享。
本月的技术干货q&a分享我们将给大家带来在ds中使用正则表达式选择蛋白中的氨基酸的小技巧，可以极大的方便我们来有目的批量选择氨基酸。
菜单-edit-select ...打开菜单，如下图设置，选择正则表达式：t.r..
根据正则表达式的规则，点可以代表一个字符，比如字母或数字，因此，t.r..中前三个字符代表氨基酸名中第一个字母是t，第二个字母不定，第三个字母为r的氨基酸，这样就只有thr和tyr，r后面点的个数代表了数字的位数，如果是100号之前，则r之后只有两个数字，所以是两个点，点击apply后可以看到，蛋白中序号为两位数的tyr和thr被选中了。依次类推，如果选择序号为个位数的，可以使用t.r.来匹配，当然前提是蛋白结构中10号之前得有相应氨基酸，否则是选不上的。部分正则匹配规则如下：
同样，如果寻找序列号在10-19之间的t.r类氨基酸可以使用t.r1.来匹配查找，具体其它正则表达式大家有兴趣可以自己探索一下。